Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 SKI8YGL213C 1194 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 EST3YIL009C-A 546 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YJL171CYJL171C 1191 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 LAC1YKL008C 1257 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 URA5YML106W 681 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 PRS4YBL068W 981 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 TUF1YOR187W 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 CBS1YDL069C 690 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 RTT103YDR289C 1230 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 GIC2YDR309C 1152 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YIP4YGL198W 708 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 PUP2YGR253C 783 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 END3YNL084C 1050 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YOL035CYOL035C 303 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YOR097CYOR097C 528 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 OPT1YJL212C 2400 nt7.5□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YLL058WYLL058W 1728 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 TRS31YDR472W 852 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YFL019CYFL019C 354 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 REC107YJR021C 945 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YNR005CYNR005C 405 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 ARG8YOL140W 1272 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 SMA1YPL027W 738 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 HBN1YCL026C-B 582 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 TAH11YJR046W 1815 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 PAC2YER007W 1557 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 RGD2YFL047W 2145 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 TEP1YNL128W 1305 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YEL023CYEL023C 2049 nt7.49□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 MIP1YOR330C 3765 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YLR345WYLR345W 1530 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 ADK2YER170W 678 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 NCS6YGL211W 1080 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 SCEIQ0160 708 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 RSM26YJR101W 801 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YNL171CYNL171C 369 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 MET16YPR167C 786 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YLL066CYLL066C 3618 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 TEC1YBR083W 1461 nt7.48□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YJL045WYJL045W 1905 nt7.47□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 CBR1YIL043C 855 nt7.47□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 RPL31BYLR406C 342 nt7.47□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 HTZ1YOL012C 405 nt7.47□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YOR268CYOR268C 399 nt7.47□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 HSE1YHL002W 1359 nt7.46□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 RQC1YDR333C 2172 nt7.46□□□□□ -1.21
RPS6BP0CX38 YDR249CYDR249C 1122 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 ERJ5YFR041C 888 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 KXD1YGL079W 657 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 POP6YGR030C 477 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 PEX13YLR191W 1161 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RPR1RPR1 369 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 SRL4YPL033C 846 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 PEX32YBR168W 1242 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YOR389WYOR389W 1875 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 SSU1YPL092W 1377 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 APM3YBR288C 1452 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 PFA5YDR459C 1125 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 IRC7YFR055W 1023 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YFR057WYFR057W 456 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 NVJ1YHR195W 966 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RFC4YOL094C 972 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YPR153WYPR153W 423 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 COR1YBL045C 1374 nt7.45□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 APE4YHR113W 1473 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 CHS5YLR330W 2016 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RPL2BYIL018W 765 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YKL169CYKL169C 384 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 SPC34YKR037C 888 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 DRE2YKR071C 1047 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 CPR6YLR216C 1116 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 MRPL4YLR439W 960 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YNR014WYNR014W 639 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 VAC17YCL063W 1272 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 IRC6YFR043C 714 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 VMA6YLR447C 1038 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 PRE5YMR314W 705 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 REX4YOL080C 870 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RIT1YMR283C 1542 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 VBA5YKR105C 1749 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 MRPS28YDR337W 861 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YGL177WYGL177W 348 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YJL215CYJL215C 360 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YLR225CYLR225C 1224 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YNR025CYNR025C 360 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 MDM12YOL009C 816 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 IPP1YBR011C 864 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 TGS1YPL157W 948 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 MRL1YPR079W 1146 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 YPR109WYPR109W 885 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 RBS1YDL189W 1374 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 NDE1YMR145C 1683 nt7.41□□□□□ -1.22
RPS6BP0CX38 UPS3YDR185C 540 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms