Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2MP0CAP2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2MP0CAP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms