Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L7P0C7H9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L7P0C7H9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms