Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD63P08962 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD63P08962 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD63P08962 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD63P08962 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD63P08962 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD63P08962 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD63P08962 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD63P08962 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD63P08962 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD63P08962 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD63P08962 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD63P08962 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD63P08962 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD63P08962 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD63P08962 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD63P08962 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD63P08962 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD63P08962 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD63P08962 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD63P08962 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD63P08962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD63P08962 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD63P08962 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD63P08962 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD63P08962 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD63P08962 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD63P08962 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms