Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLK3P07288 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLK3P07288 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLK3P07288 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLK3P07288 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLK3P07288 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLK3P07288 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLK3P07288 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLK3P07288 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLK3P07288 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLK3P07288 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLK3P07288 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLK3P07288 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLK3P07288 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLK3P07288 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLK3P07288 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLK3P07288 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLK3P07288 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLK3P07288 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLK3P07288 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLK3P07288 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLK3P07288 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLK3P07288 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLK3P07288 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLK3P07288 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLK3P07288 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLK3P07288 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLK3P07288 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLK3P07288 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLK3P07288 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLK3P07288 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms