Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LPLP06858 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LPLP06858 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LPLP06858 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LPLP06858 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LPLP06858 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LPLP06858 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LPLP06858 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LPLP06858 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LPLP06858 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LPLP06858 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LPLP06858 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LPLP06858 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LPLP06858 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LPLP06858 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LPLP06858 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LPLP06858 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LPLP06858 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LPLP06858 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LPLP06858 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LPLP06858 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LPLP06858 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LPLP06858 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LPLP06858 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LPLP06858 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LPLP06858 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPLP06858 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPLP06858 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPLP06858 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LPLP06858 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LPLP06858 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPLP06858 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPLP06858 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPLP06858 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPLP06858 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LPLP06858 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms