Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAVP06756 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAVP06756 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms