Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA4P06727 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA4P06727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOA4P06727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA4P06727 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA4P06727 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA4P06727 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA4P06727 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA4P06727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA4P06727 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA4P06727 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA4P06727 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA4P06727 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA4P06727 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA4P06727 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA4P06727 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA4P06727 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA4P06727 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA4P06727 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA4P06727 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA4P06727 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA4P06727 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA4P06727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA4P06727 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA4P06727 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA4P06727 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA4P06727 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA4P06727 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA4P06727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA4P06727 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA4P06727 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA4P06727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA4P06727 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA4P06727 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA4P06727 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA4P06727 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA4P06727 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA4P06727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA4P06727 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA4P06727 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA4P06727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA4P06727 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms