Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RB1P06400 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RB1P06400 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RB1P06400 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RB1P06400 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RB1P06400 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RB1P06400 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RB1P06400 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RB1P06400 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RB1P06400 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RB1P06400 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RB1P06400 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RB1P06400 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RB1P06400 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RB1P06400 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RB1P06400 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RB1P06400 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RB1P06400 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RB1P06400 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RB1P06400 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RB1P06400 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RB1P06400 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RB1P06400 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RB1P06400 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RB1P06400 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RB1P06400 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RB1P06400 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RB1P06400 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RB1P06400 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RB1P06400 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RB1P06400 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RB1P06400 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RB1P06400 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RB1P06400 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RB1P06400 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RB1P06400 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RB1P06400 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RB1P06400 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RB1P06400 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RB1P06400 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RB1P06400 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RB1P06400 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RB1P06400 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RB1P06400 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RB1P06400 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RB1P06400 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RB1P06400 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RB1P06400 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RB1P06400 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RB1P06400 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RB1P06400 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RB1P06400 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RB1P06400 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RB1P06400 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RB1P06400 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RB1P06400 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RB1P06400 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RB1P06400 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RB1P06400 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RB1P06400 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RB1P06400 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RB1P06400 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RB1P06400 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RB1P06400 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RB1P06400 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RB1P06400 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RB1P06400 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RB1P06400 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RB1P06400 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RB1P06400 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RB1P06400 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RB1P06400 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RB1P06400 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RB1P06400 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RB1P06400 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RB1P06400 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms