Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYL1P05976 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYL1P05976 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYL1P05976 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYL1P05976 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYL1P05976 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MYL1P05976 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYL1P05976 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYL1P05976 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYL1P05976 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYL1P05976 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYL1P05976 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYL1P05976 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYL1P05976 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL1P05976 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL1P05976 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL1P05976 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL1P05976 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL1P05976 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL1P05976 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL1P05976 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL1P05976 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL1P05976 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL1P05976 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL1P05976 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL1P05976 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL1P05976 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL1P05976 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL1P05976 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL1P05976 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYL1P05976 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYL1P05976 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYL1P05976 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYL1P05976 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYL1P05976 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYL1P05976 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYL1P05976 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYL1P05976 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYL1P05976 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYL1P05976 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYL1P05976 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYL1P05976 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYL1P05976 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYL1P05976 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYL1P05976 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYL1P05976 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYL1P05976 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYL1P05976 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYL1P05976 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms