Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3DP05423 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3DP05423 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms