Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMG1P04279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMG1P04279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms