Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT6BP04259 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6BP04259 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6BP04259 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms