Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTNP04004 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VTNP04004 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTNP04004 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTNP04004 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTNP04004 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTNP04004 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTNP04004 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTNP04004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTNP04004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTNP04004 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTNP04004 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VTNP04004 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTNP04004 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTNP04004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTNP04004 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTNP04004 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTNP04004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTNP04004 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTNP04004 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTNP04004 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTNP04004 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTNP04004 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTNP04004 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTNP04004 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTNP04004 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTNP04004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTNP04004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTNP04004 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTNP04004 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTNP04004 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTNP04004 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTNP04004 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTNP04004 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VTNP04004 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VTNP04004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VTNP04004 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VTNP04004 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VTNP04004 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTNP04004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTNP04004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTNP04004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTNP04004 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTNP04004 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTNP04004 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTNP04004 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTNP04004 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTNP04004 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTNP04004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTNP04004 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTNP04004 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTNP04004 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTNP04004 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTNP04004 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTNP04004 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTNP04004 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTNP04004 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VTNP04004 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms