Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC2P02585 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC2P02585 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms