Protein–RNA interactions for Protein: P02538

KRT6A, Keratin, type II cytoskeletal 6A, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6AP02538 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT6AP02538 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT6AP02538 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6AP02538 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms