Protein–RNA interactions for Protein: P01579

IFNG, Interferon gamma, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNGP01579 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNGP01579 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNGP01579 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNGP01579 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNGP01579 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNGP01579 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNGP01579 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNGP01579 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNGP01579 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNGP01579 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNGP01579 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNGP01579 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNGP01579 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNGP01579 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNGP01579 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNGP01579 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNGP01579 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNGP01579 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNGP01579 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNGP01579 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNGP01579 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNGP01579 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNGP01579 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNGP01579 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNGP01579 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNGP01579 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNGP01579 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNGP01579 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNGP01579 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNGP01579 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNGP01579 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNGP01579 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNGP01579 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNGP01579 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNGP01579 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms