Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCAP01258 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCAP01258 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCAP01258 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCAP01258 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCAP01258 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCAP01258 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCAP01258 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCAP01258 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCAP01258 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCAP01258 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCAP01258 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCAP01258 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCAP01258 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCAP01258 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCAP01258 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCAP01258 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCAP01258 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCAP01258 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALCAP01258 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCAP01258 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCAP01258 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCAP01258 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCAP01258 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCAP01258 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCAP01258 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCAP01258 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCAP01258 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCAP01258 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCAP01258 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCAP01258 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCAP01258 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCAP01258 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCAP01258 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCAP01258 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCAP01258 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCAP01258 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCAP01258 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCAP01258 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCAP01258 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCAP01258 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCAP01258 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCAP01258 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCAP01258 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCAP01258 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1073.6 ms