Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F13A1P00488 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F13A1P00488 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F13A1P00488 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F13A1P00488 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F13A1P00488 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F13A1P00488 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F13A1P00488 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F13A1P00488 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F13A1P00488 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
F13A1P00488 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
F13A1P00488 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
F13A1P00488 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F13A1P00488 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F13A1P00488 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F13A1P00488 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F13A1P00488 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
F13A1P00488 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F13A1P00488 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F13A1P00488 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
F13A1P00488 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
F13A1P00488 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
F13A1P00488 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
F13A1P00488 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
F13A1P00488 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
F13A1P00488 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
F13A1P00488 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
F13A1P00488 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
F13A1P00488 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
F13A1P00488 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
F13A1P00488 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F13A1P00488 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F13A1P00488 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F13A1P00488 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
F13A1P00488 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms