Protein–RNA interactions for Protein: P00441

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1P00441 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOD1P00441 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOD1P00441 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOD1P00441 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOD1P00441 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD1P00441 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD1P00441 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD1P00441 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD1P00441 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOD1P00441 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOD1P00441 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOD1P00441 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOD1P00441 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOD1P00441 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD1P00441 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD1P00441 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOD1P00441 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOD1P00441 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOD1P00441 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOD1P00441 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOD1P00441 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOD1P00441 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD1P00441 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD1P00441 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD1P00441 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD1P00441 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOD1P00441 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD1P00441 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD1P00441 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD1P00441 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOD1P00441 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOD1P00441 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD1P00441 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD1P00441 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD1P00441 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD1P00441 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD1P00441 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD1P00441 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD1P00441 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD1P00441 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD1P00441 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOD1P00441 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOD1P00441 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOD1P00441 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOD1P00441 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD1P00441 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD1P00441 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD1P00441 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOD1P00441 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms