Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHEK2O96017 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHEK2O96017 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHEK2O96017 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms