Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVILO95425 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVILO95425 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVILO95425 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVILO95425 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVILO95425 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVILO95425 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVILO95425 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVILO95425 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVILO95425 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVILO95425 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVILO95425 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVILO95425 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVILO95425 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SVILO95425 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SVILO95425 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SVILO95425 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SVILO95425 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SVILO95425 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVILO95425 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVILO95425 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SVILO95425 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVILO95425 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVILO95425 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVILO95425 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVILO95425 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVILO95425 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVILO95425 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVILO95425 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SVILO95425 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVILO95425 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVILO95425 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVILO95425 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVILO95425 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVILO95425 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SVILO95425 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVILO95425 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SVILO95425 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SVILO95425 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms