Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC2O95409 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC2O95409 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms