Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN3O95197 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN3O95197 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN3O95197 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN3O95197 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
RTN3O95197 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN3O95197 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN3O95197 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN3O95197 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTN3O95197 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN3O95197 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN3O95197 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN3O95197 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN3O95197 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN3O95197 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN3O95197 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN3O95197 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN3O95197 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTN3O95197 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTN3O95197 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN3O95197 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN3O95197 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN3O95197 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN3O95197 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN3O95197 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN3O95197 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN3O95197 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN3O95197 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN3O95197 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN3O95197 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN3O95197 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN3O95197 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms