Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP5O95183 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP5O95183 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP5O95183 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 386.1 ms