Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH1A2O94788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A2O94788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms