Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP1O94782 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP1O94782 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP1O94782 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP1O94782 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP1O94782 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP1O94782 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP1O94782 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP1O94782 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP1O94782 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP1O94782 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP1O94782 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP1O94782 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP1O94782 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP1O94782 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP1O94782 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP1O94782 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP1O94782 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP1O94782 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP1O94782 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP1O94782 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP1O94782 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP1O94782 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP1O94782 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP1O94782 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms