Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB2O75838 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB2O75838 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB2O75838 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB2O75838 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB2O75838 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB2O75838 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB2O75838 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB2O75838 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB2O75838 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB2O75838 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB2O75838 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms