Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F6O75461 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F6O75461 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F6O75461 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F6O75461 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F6O75461 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F6O75461 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F6O75461 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F6O75461 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F6O75461 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F6O75461 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F6O75461 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F6O75461 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F6O75461 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F6O75461 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F6O75461 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F6O75461 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F6O75461 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F6O75461 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F6O75461 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms