Protein–RNA interactions for Protein: O75064

DENND4B, DENN domain-containing protein 4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4BO75064 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DENND4BO75064 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
DENND4BO75064 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
DENND4BO75064 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DENND4BO75064 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DENND4BO75064 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms