Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN2BO60939 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN2BO60939 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms