Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSVO60911 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSVO60911 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSVO60911 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSVO60911 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSVO60911 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSVO60911 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSVO60911 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSVO60911 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSVO60911 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSVO60911 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSVO60911 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSVO60911 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSVO60911 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSVO60911 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSVO60911 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSVO60911 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSVO60911 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSVO60911 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSVO60911 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSVO60911 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSVO60911 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSVO60911 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSVO60911 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSVO60911 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSVO60911 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSVO60911 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSVO60911 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSVO60911 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSVO60911 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSVO60911 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSVO60911 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms