Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPX2O60687 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPX2O60687 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPX2O60687 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms