Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR5O60602 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR5O60602 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR5O60602 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR5O60602 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR5O60602 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR5O60602 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR5O60602 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR5O60602 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR5O60602 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR5O60602 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR5O60602 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR5O60602 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR5O60602 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR5O60602 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR5O60602 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR5O60602 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR5O60602 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR5O60602 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR5O60602 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR5O60602 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR5O60602 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR5O60602 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR5O60602 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR5O60602 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR5O60602 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TLR5O60602 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR5O60602 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR5O60602 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR5O60602 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR5O60602 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR5O60602 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR5O60602 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR5O60602 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR5O60602 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR5O60602 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms