Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GREM1O60565 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GREM1O60565 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREM1O60565 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GREM1O60565 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GREM1O60565 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GREM1O60565 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GREM1O60565 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GREM1O60565 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREM1O60565 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREM1O60565 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GREM1O60565 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREM1O60565 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREM1O60565 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREM1O60565 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREM1O60565 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREM1O60565 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREM1O60565 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREM1O60565 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREM1O60565 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREM1O60565 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREM1O60565 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GREM1O60565 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREM1O60565 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREM1O60565 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREM1O60565 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREM1O60565 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREM1O60565 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREM1O60565 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREM1O60565 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREM1O60565 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREM1O60565 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREM1O60565 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREM1O60565 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREM1O60565 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GREM1O60565 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREM1O60565 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREM1O60565 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREM1O60565 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREM1O60565 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREM1O60565 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREM1O60565 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GREM1O60565 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREM1O60565 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GREM1O60565 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GREM1O60565 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms