Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF9O60383 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF9O60383 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF9O60383 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF9O60383 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF9O60383 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF9O60383 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF9O60383 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF9O60383 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF9O60383 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF9O60383 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF9O60383 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF9O60383 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF9O60383 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF9O60383 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF9O60383 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF9O60383 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF9O60383 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF9O60383 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF9O60383 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF9O60383 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF9O60383 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF9O60383 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF9O60383 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF9O60383 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF9O60383 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF9O60383 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF9O60383 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF9O60383 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF9O60383 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF9O60383 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF9O60383 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF9O60383 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF9O60383 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF9O60383 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF9O60383 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF9O60383 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF9O60383 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF9O60383 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF9O60383 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF9O60383 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF9O60383 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF9O60383 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF9O60383 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms