Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR3O43761 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR3O43761 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms