Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKAB2O43741 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKAB2O43741 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms