Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIMM44O43615 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMM44O43615 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMM44O43615 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms