Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF13O43567 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF13O43567 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF13O43567 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF13O43567 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF13O43567 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF13O43567 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF13O43567 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF13O43567 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF13O43567 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF13O43567 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF13O43567 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF13O43567 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF13O43567 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF13O43567 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF13O43567 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF13O43567 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF13O43567 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms