Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERI3O43414 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERI3O43414 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERI3O43414 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERI3O43414 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERI3O43414 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERI3O43414 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERI3O43414 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERI3O43414 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERI3O43414 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERI3O43414 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERI3O43414 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERI3O43414 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERI3O43414 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERI3O43414 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms