Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF3O43395 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF3O43395 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF3O43395 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms