Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIAH2O43255 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIAH2O43255 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIAH2O43255 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms