Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHGDHO43175 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHGDHO43175 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms