Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS1O15524 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOCS1O15524 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms