Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHADO15335 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHADO15335 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHADO15335 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHADO15335 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHADO15335 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHADO15335 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHADO15335 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHADO15335 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHADO15335 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHADO15335 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHADO15335 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHADO15335 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHADO15335 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHADO15335 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHADO15335 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHADO15335 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHADO15335 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHADO15335 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHADO15335 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHADO15335 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHADO15335 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHADO15335 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHADO15335 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHADO15335 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHADO15335 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHADO15335 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHADO15335 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHADO15335 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHADO15335 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHADO15335 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHADO15335 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHADO15335 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHADO15335 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHADO15335 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHADO15335 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHADO15335 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHADO15335 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHADO15335 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHADO15335 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHADO15335 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHADO15335 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHADO15335 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHADO15335 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHADO15335 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CHADO15335 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHADO15335 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHADO15335 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms