Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBDO15205 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBDO15205 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBDO15205 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBDO15205 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBDO15205 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBDO15205 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBDO15205 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBDO15205 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBDO15205 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBDO15205 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBDO15205 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBDO15205 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBDO15205 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBDO15205 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBDO15205 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBDO15205 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBDO15205 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBDO15205 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBDO15205 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBDO15205 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBDO15205 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBDO15205 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBDO15205 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBDO15205 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms