Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1CO15160 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms