Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP290O15078 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP290O15078 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP290O15078 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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