Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETD1AO15047 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SETD1AO15047 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SETD1AO15047 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SETD1AO15047 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
SETD1AO15047 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SETD1AO15047 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SETD1AO15047 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SETD1AO15047 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SETD1AO15047 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SETD1AO15047 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SETD1AO15047 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SETD1AO15047 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SETD1AO15047 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SETD1AO15047 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SETD1AO15047 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SETD1AO15047 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SETD1AO15047 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SETD1AO15047 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms